「アリス イン ナイトメア」は残念ながら，ジョイスティック対応を公式には謳っていない。その理由として開発側は「出荷までに，ジョイスティックサポートを正式に言えるだけのテスト時間が取れなかった」と述べている。
　しかし実際には，以下の方法でジョイスティックを使ってプレイすることが可能になる。

1.トップメニューの"Setting"内にある"CONSOLE"(一番下)にチェックを入れる。
2.ゲームプレイ画面で「~」 =チルダキーを押して（日本語キーボードの場合は半角/全角キー）コンソールウインドウを表示させ，　in_joystick 1　とコマンドを入力しEnterキーを押す。
3.次に　in_restart　と入力してEnterキーを押す。
4."Controls"メニューでジョイスティックボタンに各動作等を割り当てる。

　これで，ゲーム側がジョイスティック入力を認識するようになるので，以後ジョイスティックでのプレイが可能となる。マウスとキーボードでのプレイに不満を感じている人は試してみよう。